علل اختلال عملکرد جنسي در بيماران با درد مزمن چند عاملی است و اغلب عوامل فيزيولوژيك ، فارماكولوژيك و سايكولوژيك مطرح هستند. در يك مطالعه در 73% بيماران با درد مزمن مشكل در فعاليت جنسي به خاطر درد داشتند. علل اين مشكل شامل كاهش تحریک، موارد مربوط به وضعیت مناسب، تشديد درد، اعتماد بنفس پايين، نگراني از اجرا و اشکال در ارتباط ميباشد. در يك مطالعه ديگر مشكلات جنسي در 64% بيماران با کمردرد ديده شده است. در زنان با کمردرد فركانس فعاليت جنسي شان كمتر شده است، حين مقاربت دردشان بيشتر ميشود، ميل جنسي شان نسبت به مردان مبتلا به کمردرد يا افراد مبتلا به گردن درد كاهش بيشتري دارد.
اختلال عملکرد جنسي در بيماران با درد مزمن با افسردگی، مكانيسمهاي تطابق ضعيف، مدت درد كوتاهتر ارتباط بالای دارد. بسياري از داروها شامل اپيوييد ها، ضد افسردگيها ، ضد تشنجها به طور مستقل باعث اختلال عملکرد جنسي ميشوند. درد مزمن لگن در زنان كه به طور شايع باعث ديس پاروني و اختلال عملکرد جنسي ميشود ميتواند به علت سوئ استفاده جنسي يا غفلت احساسي یا فیزیکی در کودکی باشد. ميتواند علل جسمی نیز داشته باشد.